一、埋藏：首先要挖宽1米左右，深0.6-1.5米(气温不同沟深也不一样，一般在冻土层以下稍深处)的土沟，然后将心里美萝卜码在沟底。堆码时心里美萝卜根部朝上，一个接一个排紧，摆放一层后用干净、湿润的细土覆盖一薄层(一般用沟底土覆盖)，上面再摆一层心里美萝卜，再覆盖一层细土……，最后用细土覆盖，整平，压实。一周后在上面浇水一次，浇水量可根据土壤性质、土壤湿度、贮藏品种而定。浇水用干净水，不应用污水。为了防止热伤或冻害，在初期覆盖土层一定要薄，使沟内心里美萝卜热量易排出；后期因外界气温下降，要适当覆盖一些土或盖草袋等。沟内温度保持在1-3℃。
二、窖藏。心里美萝卜窖藏前要进行预贮，待外界气温降至1-2℃时，再将心里美萝卜入窖，窖内摆放方式有码垛和散堆两种，堆或垛的高度为1-1.5米，堆或垛内每隔1米可设置10厘米左右的通风筒，堆与堆或垛与垛之间要留出一定的空隙，以利于散热和通风。为了防止心里美萝卜糠心，窖底要铺8-10厘米的湿细砂，然后，一层心里美萝卜一层细砂交替进行。心里美萝卜入窖约1个月后可以翻倒1次，上下置换，并挑出有病伤等不能贮藏的心里美萝卜。在贮藏期间窖内温度控制为1-2℃，相对湿度为90-95％。
三、气调保鲜。通过气调保鲜，大心里美萝卜可以贮藏到翌年5月，而且还能保持鲜嫩状态。首先将心里美萝卜在贮藏前晾晒一天，然后装入筐内，在贮藏间内码成方形垛，每垛48筐，在筐外用聚乙烯塑料账密封，采用自然降氧法进行贮藏。账内氧气控制在2-5%，二氧化碳在5%以下。库内温度在1℃±0.5℃，库温不应波动太大，防止出现凝结水而引起腐烂。
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