从植物学上讲，菠菜种子实际上就是它的果实，其胚珠受精后胞片硬化，成为整个果实的外壳，故也称胞果。有的品系胞片上长有1——6个突起，称为刺，所以，菠菜依果实形状可分为刺籽菠菜和圆籽菠菜两种类型。刺籽菠菜种子一般呈菱角状，圆籽菠菜种子呈圆形、卵圆形或椭圆形。由于菠菜种子的果皮厚而坚硬，不易透水透气，故发芽缓慢。如果在播种前将种子搓一搓，能够将种子的果皮搓破，便于播种后较快吸水、透气，利于出苗。
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