砧木苗的培育砧木苗通常采用实生繁育。
(1)采种选择品类品种纯正的砧木母本树，采摘已经充分成熟的果实，未成熟的落果和病果不能用来采种。砧木品系要单一，不能混同。
采集的果实要准时取种，种子要清洗干净。种子外皮有胶质，可包在麻布里搓洗，但不可用力过猛，以免种皮破裂。冲洗过后的鲜湿种子，阴干或在弱日光下晾至种皮发白，互相不黏着为度，晾晒的过程中要经常翻动。切忌过度干燥，影响发芽能力。
柑橘种子没有休眠期，在无霜冻的地区能够随采随播。如果需要贮藏，可用一般沙藏法。如果需要远途运送，则能够用河沙、木炭粉或谷壳混在一起，用木箱或麻袋装运，不能用塑料薄膜包装，每件体积不宜过大，以防种子发热霉变，丧失发芽力。
近年来，在广西、广东等地也采用嫩种育苗，即从未成熟的果实中采种后直接播种，或经催芽后播种育苗。
(2)播种
①播种期间播种期间按照气候条件而定，华南无霜冻地区，以12月播种为宜，长江流域以及闽北、粤北、桂北等地，一般均在2-3月播种。如果采用嫩种育苗，则随采随播。如枳的嫩种在7月中下旬或8月，酸橘嫩种可在9月下旬，雪柑嫩种可在10月中旬播种，当年即可萌发，发芽率在80％以上。此类砧木苗次年夏秋天节即可进行嫁接，冬春天出圃，由播种到嫁接苗出圃约需1.5-2年。嫩种秋播要催芽；以提升发芽率和苗木出土整齐度。
②播种量播种量按种子粒数计，约为所需砧木数的1-2倍，播种不宜过密，以免影响小苗成长。
