芹菜的生理性病害有烧心、空心、叶柄开裂和缺硼症。以上生理性病害能严重影响芹菜的成长，下降其产量及品质。
烧心症状：开始心叶叶脉变褐、逐渐叶缘细胞坏死，呈黑褐色。在生育初期很少发生，多在11~12片真叶时开始形成。产生条件和 因素：烧心在高温、干旱、施肥过量的条件下容易产生。高温能加速成长发育速度，促使植物对氮、钾、镁等元素的过多吸取，从而影响对钙的汲取。而烧心是由缺钙导致的。在于旱条件下，由于根系对钙元素的吸取能力减弱，易导致植株缺钙，越是酸性土壤则出现越重。防治和治疗办法：首先要防止高温干旱，进行适温适湿管理；对酸性土壤可施用生石灰调节到中性或接近中性；施氮、钾、镁等肥料要适量。一旦出现烧心症状，可用0.5%的氟化钙或硝酸钙溶液向叶面喷雾。
空心症状：空心是一种生理老化征象，形成的位置是叶柄，是叶柄髓位置和输导组织细胞老化，细胞液胶质化失去活力和细胞膜出现孔隙。多从叶柄基部向上延伸，在同一植株上外叶先于内叶，由叶基到第一节间出现较早。叶柄空心位置呈白色絮状，木栓化组织增长。产生条件和起因：空心在沙性大的土壤中出现较多、进度较快，肥分不足或后期脱肥时也有产生。成长过熟或过多喷施赤霉素等，土壤干旱或温度太高或太低也易形成。防治和治疗办法：应防止在沙性过大的土壤上种植。除施足基肥外，在成长发育过程中要准时追肥，如发现叶子颜色转浓发生脱肥征象时，可用0.1%的尿素液肥进行根外追肥。
