所谓黄瓜根系生理性死亡是指黄瓜侧根及毛细根量显著减少，根系木质部变褐或腐烂，显著死亡的根系通过一段时间恢复还能生出侧根，黄瓜根系在整个生育周期内有两次显著的生理性死亡。
第一次生理性死亡是在开花后15—20天至第一果实收获时。此期，植株营养物质开始向生殖成长供应，由于果实截留了一些养分，使得根系不适应此类变化，因而植株侧根及毛细根形成量有所减少，后期管理不妥可引起一些根系变褐或腐烂。生产上能够采取如下预防办法：根瓜采收前促根促秧让植株平衡成长；根瓜及早采摘，以免坠秧；根瓜采收前后增加肥水管理。
第二次生理性死亡约在腰瓜采摘中后期，即植株成长期达100天左右时开始。植株通过前期旺盛结果，此时开始步人成长后期，根系开始逐渐衰退，根量显著减少，上部叶子颜色变浅，龙头伸长速度减慢，茎细弱，植株成长显著减缓。如若管理不妥，将严重影响后期产量，使植株提早拉秧。生产上能够采取如下预防办法：1.增施有机肥，改善土壤的团粒结构，为根系的成长供给良好的条件。2.呵护地生产应中耕，疏松土壤，加强土壤中的含氧量，促使根系再生。3.调节植株养分成长与生殖成长的关系，种植上此期不能够让植株坠大瓜，瓜条长成即采收，必要时可进行恰当疏瓜。4.增加植株营养物质及病虫害防治和治疗，准时进行叶面追肥，迅速补充植株养份。叶面追肥可随病虫害防治和治疗同时进行，7~10天1次，可选用氨基酸叶面肥、糖醋液(糖1份、尿素1份、磷酸二氢钾1份、醋2份)50~100倍液。待新根大量形成，再逐渐转入正常管理。5.喷施成长素，促使新根快发，可用0.1%萘乙酸水剂600~800倍液喷雾1次。6.水分管理上以见干见湿为宜。
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