红豆苗期主要病害有猝倒病、根腐病和叶枯病；害虫主要为蚯蚓、地老虎、蛴螬、蜘蛛和蚜虫等。
发生猝倒病可用0.5:0.5:100或1:1:100 倍半量或等量波尔多液喷雾进行防治，每隔7-10天喷一次，连续喷3-5次。效果良好；
发生根腐病可用多菌灵或甲基托布津500倍溶液进行防治，每隔5- 7天防治1次，连续3次，可抑制病害扩散蔓延，还要及时拔病株就地烧毁。
发现蚯蚓、地老虎、蛴螬为害，可用呋喃丹挖条撒施于苗床上防治地下害虫；蜘蛛、蚜虫可用敌敌畏、乐果类。
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