繁育红豆杉首先应选种好土壤地块，选择疏松、富含腐殖质、呈中性或微酸性的高山台地、沟谷溪流两岸的深厚湿润性棕壤、暗棕壤为好。深翻、整平，按株行距0．4米×1．0米或0．4米×0．4米开穴，穴深40厘米，备栽。
红豆杉的繁育对策有种子繁育和扦插繁育，以育苗移栽为主。
一、种子育苗
1、采种催芽
10月中下旬，在红豆杉果实呈深红色时采收种子。该种子属生理后熟，需要通过1年的湿沙贮藏才能发芽。为提升发芽率，常采取室外自然变湿沙藏层积法对红豆杉种子进行催芽处理。
2、圃地选择
圃地选择以土层深厚、结构疏松、富含有机质、排水良好、不受西晒的稻田为宜(务必是当年收割的稻田土)。整地在收割中晚稻后，土壤干燥后深翻一次，碎土一次，尔后分厢做床。宽床1.5米(净床面宽1.2米，步道宽0.3米)；床高20厘米，苗床长度视苗圃地而定。
3、圃地施肥
在整地做床的同时，每亩施入腐熟的猪牛粪8000斤左右，速溶优质复合肥200斤，并拌入呋喃丹6至8斤防治和治疗地下害虫。在将肥料翻拌入土层并将整平厢面后，在厢面上填黄心土，厚5厘米。
4、适期播种
红豆杉种子的播种分撒播和条播两种：撒播是将红豆杉种子匀称地撒在填好黄心土的苗床上，用黄心土覆盖种子，以不见种子为度，再用苔藓将苗床所有覆盖。条播则选取15厘米宽的木板，在填好黄心土的苗床上压播种沟，深2厘米，播种沟之间的距离15至20厘米。将红豆杉种子匀称播种于沟内，并用黄心土盖种，厚度1厘米，再用苔藓覆盖播种沟。
一般在早春播种。红豆杉种子贮藏1年后，有30%种子裂口现白时，准时筛出种子，放在0．2%的高锰酸钾溶液中消毒10分钟，再用清水冲洗干净，晾干明水后匀称地播在沟内。条播为主，粒距5-7厘米。也可采用撒播。播种后，挖取松林下带有菌根并过筛的黄壤土覆盖种子，厚度以不见种子为度。
应堤防的是：一是严格抑制播种量，每亩用种为15千克，否则会严重影响二年生红豆杉苗木合格出苗率；二是播种后，撒播必需用苔藓将苗床所有覆盖，条播只要将苔藓覆盖播种沟。新苗出土后，也不要将苔藓揭去，长期坚持在苗床上。
5、苗期管理
红豆杉种子出苗率在70%以上。红豆杉小苗期堤防遮荫，播种时覆盖稻草以不见土为适宜，苗期搭建荫棚，透光度在60%。然后铺植苔藓护苗，呵护苗床不受日晒雨淋，并经常坚持土壤疏松、湿润。
苔藓护苗优点为：呵护苗床不受雨水溅击和日光直射，使苗木不受日光灼伤及防止因茎、叶沾泥发生泥棒而窒息死亡，并且经常坚持土壤疏松、湿润，减少中耕锄草用工。但覆盖的苔藓要薄，不能太厚，如遇久旱不雨，可用细黄土压住苔藓，或用喷雾器喷水坚持苗床湿润。
二、扦插育苗
在红豆杉休眠萌动期，选择砂土、锯末、珍珠岩混在一起基质作扦插土。选择1-4年生的红豆杉木质化实生枝，将插条剪为10厘米、15厘米或30厘米长的小段，在剪枝时.要求切口平滑、下切口马耳形，2/3以下去叶。选择药剂如ATP、ABT、NAA、IBAA等处理插枝后扦插、盖膜，扦插成活率一般在85%以上。苗期堤防保暖，搭建低棚遮荫。翌年移栽。
每年5-6月份剪取当年红豆杉半木质化枝作插条，母树选择10年以下树龄。长度15-20厘米，剪去下部小枝、针叶剪成马蹄形，放在ABT7号生根粉中浸泡，浓度为30×10～6-50×10～6，浸泡时间3-12小时。随后将插条插在基质为河沙的苗床上。苗床要求1米宽，长度适宜，扦插深度3-5厘米。行株距10cm×8cm，随即喷水。苗床上撘架，用塑料布覆盖，每日喷水2-3次，半月后每日喷水1次。一般地温坚持20-30摄氏度，不要强光照射，30-40天即可生根。在此时期，可喷施芸苔素等叶面肥，促使成长。
当红豆杉幼芽生根后，精细管理促使旺长，并恰当通风透光炼苗，加强抗逆性。炼苗结束后可移栽在大苗床上。
红豆杉新苗一般在苗床成长2-3年，每年按时喷成长素、叶面肥精心管理。当苗高50-100厘米时即可上山造林成片栽种。栽植时间为秋末或春天均可，株行距可按3米×4米，亦可在街道、公园、作观赏树栽。
三、移栽
一般红豆杉种子育苗的1-2年，扦插繁育的1年左右，当红豆杉苗高长至30～50厘米即可移栽。移栽在10-11月或2-3月萌芽前进行，每穴栽苗1株，浇水，恰当遮萌。
