把生产的花椰菜储藏起来，在寒冬和早春供应市场，可获得较好的效益。适宜储藏的条件是温度0-1摄氏度（低于0摄氏度会受冻，高于8摄氏度会变黄、变暗），相对湿度90%-95%。储藏环境的空气成分氧气占3%-4%，二氧化碳不超过5%。
秋天采收只要不受冻害，愈晚采收愈利于储藏。采收前7天不可浇水。花球采取束叶方法，即在成花期把花球周围的叶片向里折断2-3片盖住花球或将3-4片叶片束起来用稻草或绳子轻轻捆扎住，使日光不能直接射入。7-8成熟时采收较耐储藏。为避免外叶黄化和脱落，采收前1天应喷25毫升/升的2，4～D溶液或加入10-50毫升/升的6～苄基腺嘌呤溶液。向花球喷洒含量为3000毫升/升的多菌灵或硫菌灵药液。可减轻腐烂。花椰菜花球的产生在植株个体间也很不一致，应分批采收。采收时.要小心选择花球硕大、花枝慎密、花蕾致密、边缘尚未散开的花椰菜。用于假植的花椰菜植株，须连根带叶采收。采用其他办法储藏的花椰菜植株，应保留3～4片叶包被花球，以减少在运送过程中出现机械伤害。储藏中利用保湿的材料覆盖或塑料薄膜包装。
一、塑料薄膜袋储藏
用0.04毫米厚的塑料薄膜制成30厘米×34厘米的小袋，单花球包装，袋折口而不密封，放入1±0.5摄氏度的冷库中，储藏期可达65天左右，商品率高达94%左右。采用塑料薄膜小袋包装，袋内空气处于静止状态，花椰菜在高湿条件下，细胞水分丰富、膨压大、组织坚挺脆嫩、失重少。袋内温度也相对稳定，保证了花椰菜各种生理生化运动的正常进行，能够免受病菌相互侵害和机械伤害，从而大大减轻了发病率。
二、冷藏
采收后的花椰菜要尽快放到阴凉通风处或冷库中预冷，去除携带的田间热。将预冷后的花椰菜按等级、规格、产地、批次分别码入冷库间，距蒸发器至少1米。一般花椰菜装箱（筐）冷藏时，花球应朝上：箱（筐）码放时，以不损伤下层花椰菜的花球为宜。单花球套袋冷藏时，应将单个花球装入0.015毫米厚聚乙烯塑料袋规格30-35厘米×35-40厘米）中，扎口放入箱筐）内，码放时.要求花球朝下，以免袋内形成的凝结水滴在花球上酿成霉烂。冷藏温度应坚持在0±0.5摄氏度，库内相对湿度为90%-95%。在上述条件下，按照花椰菜品系和产地差别，一般冷藏办法，冷藏期限为3～5周：单花球套袋冷藏办法，冷藏期限为6-8周。
三、窖藏
储藏窖多用棚窖，建造时先在地表挖1个坑，窖顶铺设木料、秸秆，并覆土，开设1-2个窖口（天窗），供出入和通风之用。按照窖的深浅可分为地下式和半地下式。寒冷地区采用地下窖，较温暖或地下水位较高地区采用半地下窖。地下式挖土深达2.5-3米，半地下式挖土深1-1.5米，地上部土墙高1-1.5米。
储藏窖可用于晚熟春花椰菜夏天储藏，也可用于秋花椰菜冬天储藏。入窖前菜窖利用0.5%漂白粉液喷洒消毒灭菌。把整理好的花椰菜带4-6片外叶捆扎在一起，留根长约3-4厘米。储藏花椰菜可在窖内堆成塔形垛，宽约2米，高1米左右，垛间留出通风道。此法的缺点是储量少。最好采取架储，各层架相距75-100厘米，架上铺放木板，木板间留有缝隙，每层架上堆放3～6层花椰菜，并空出20厘米高的空间通风。要增加通风管理，白天关闭窖门，夜间敞开窖门使窖内温度尽可能低个别。夏天窖藏花椰菜可储15-20天。
冬天窖藏其温度管理大致分为3个阶段：第一阶段为入窖初期，此时窖内温度较高，湿度较大，应增加通风换气，以下降窖内的温度湿度。每隔4-5天要倒1次菜，协助散发菜堆内的热量，避免脱帮和腐烂。第二阶段是进入寒冷季节早先，气温、窖温都明显降低，此时应减少通风，以保温为主，避免形成冻害，20天左右倒1次菜。第三阶段是立春早先，气温、窖温又逐渐回升，此时.要尽量减缓窖温回升速度，在白天封闭气孔、天窗，避免外界热空气进入，夜间打开，放入冷空气，同时.要加强倒菜次数，防止花椰菜发热腐烂。其储藏适温为0±1摄氏度，适宜相对湿度为85%-90%。冬天窖藏花椰菜可达2-3个月。
四、挂藏
把花椰菜连根拔起，恰当留部分外叶，沿着花球叶梢处，用稻草围好扎紧，倒挂在瓦平房屋檐下即可。但要避免日光直接照射。此法适合菜农自家少量储藏。
五、假植储藏
在冬天较温暖地区，可把花椰菜连根拔出后假植在阳畦、储藏沟或棚窖等场地。在土壤结冻之前挖一长方形沟，长宽依花椰菜的数量而定，一般每条沟假植4000kg。采收时将花椰菜连根拔起，带土在露地堆放2-3天，使外叶的水分减少个别，至外叶开始萎蔫时进行假植。将花椰菜一棵棵按株行距9-13厘米的距离布列，叶子用稻草等物捆绑包住花球。假植后立刻向沟内浇水，浇水量以水能渗入土层10厘米为度，再在植株顶上覆盖花椰菜外叶，过7-8天培土，土厚10厘米左右。大雪节气前后第二次培土，加强土层厚12-14厘米。冬至时进行最后一次盖土，土层再加厚5～6厘米。3次共盖土厚约30厘米。盖土时.要力求匀称，盖得太厚，花椰菜会发热导致腐烂；盖得太薄，又会受冻。储藏初期要防热，白天盖上草席，晚上揭开，温度维持在2-3摄氏度；后期要防冻。
六、气调储藏
用塑料薄膜做成帐子，将花椰菜存放在帐内，向帐内通入普通氮气，以下降帐内氧气含量的比例，并在帐内放氢氧化钙汲取二氧化碳，用抽气泵或低压风机排换帐内气体，每隔2天用气体解析仪测定帐内氧和二氧化碳的含量，将其调至所要求的范围。花椰菜的气调储藏温度以3-8C为宜，氧气抑制在2%～5%，二氧化碳在0%-6%比较适宜，此法可储藏3-4个月。储藏前用50毫克/升的2，4～滴或6～苄基腺嘌呤液浸蘸花球根部，有助于避免外叶黄化和脱落。入库时向花球喷洒3000毫克/升苯菌灵或甲基硫菌灵溶液，可减轻其腐烂。
七、纱布围藏
把通过挑选的花球根朝下、顶朝上分层堆放在架子上，然后把通过40%甲醛300倍液消毒的白纱布或白布覆盖在储藏架四周，就可达到储藏要求。纱布应每天或隔天消毒1次，即用消毒液浸泡5分钟后沥干到不滴水为标准。此法既可增湿、减少花球水分蒸发，又能避免病菌侵入、减少花球腐烂变质。
八、打孔塑料袋衬箱储藏
将认真挑选和修整后的花椰菜，用垫衬0.025-0.03毫米厚的聚乙烯袋包装，包装袋上用直径2毫米左右的木针扎2～6个孔，扎口储藏（塑料袋也可不打孔，采用折口不密封的方式）。储藏温度为0+0.5摄氏度。此类方式保湿保鲜成效好，但要防止花球彼此间相互摩擦和挤压，减少因伤害酿成的变色和腐烂。此类方式储藏成效较单花球套袋略差。储期不宜过长，一般在40-50天。
九、大帐储藏
在冷库中搭建宽4-4.5厘米、长1.5米、高2米左右的菜架，上下分隔成4-5层，架底部铺设一层聚乙烯塑料膜作为帐底。将待储花球码放于菜架上，最后用0.12毫米厚聚乙烯薄膜制成大帐罩在菜架外并与帐底部密封。花椰菜经过自身的呼吸作用，可自发调节帐内氧气和二氧化碳的比例，但须小心氧气浓度不可低于2%、二氧化碳浓度不能高于5%。抑制办法：经过启开大帐上特制的“袖口”通风（简称透帐）。储藏最初几天呼吸强度较大，须每天或隔天透帐通风，随着呼吸强度的减弱并日趋稳定，可2-3天透帐通风1次。储藏时期15-20天检查1次，发现有病变的个体应准时处理。为避免二氧化碳损害，在帐底部撒些氢氧化钙。在菜架中、上层的周边放置部分高锰酸钾载体，储藏最与载体之比是20：1。大帐罩后也可不密封，与外界坚持经常性的微量通风，增加观察，8-10天检查1次。以上办法一般可储藏50-60天，商品率达80%左右。为下降腐烂率，在花椰菜刚入帐时就在大帐内按1公斤花椰菜用0.1毫克克霉灵（富马酸二甲酯，防霉剂）保鲜剂浸蘸在吸水性好的纸或棉布条上，多点悬挂在菜架上，熏蒸24小时后透帐排解帐内气体，能有用地控制菜体表面的病原菌。大帐储藏量较大，但是要求技术相对较高。
