玉米缺磷，体现幼芽成长缓慢，矮缩，根系发育差，叶子不紧锁，茎秆细弱；叶尖和尖缘呈紫红色，其余一些呈绿色或灰绿色，叶缘卷曲。孕穗至开花期缺磷，果穗分化发育不良，穗顶缢缩，甚至空穗，花丝也会延迟抽出，容易形成秃顶、缺粒与粒行不整齐、果穗弯曲等征象。低温高湿或干旱田块、早期根受虫害和药害、土壤板结影响根系成长等易出现。
避免玉米缺磷，可在缺磷土壤（速效磷10毫克/千克以下为极缺磷，10-20毫克/kg为中度缺磷）增施农家肥或磷肥，折合每亩施五氧化二磷5-10千克。农家肥、钙镁磷肥和磷矿粉可撒施，重过磷酸钙和磷酸二铵可条施。苗期易缺磷的地块，可用磷酸二铵等水溶性磷肥作种肥，折合每亩施五氧化二磷2-3千克，在播种前条施于播种沟内，种子不能与肥料接触。玉米营养物质成长期缺磷，可喷施浓度为1-2%的过磷酸钙、重过磷酸钙或磷酸二铵溶液，或者在植株旁边开沟追施磷肥。
玉米植株变紫色不一定均是由缺磷导致的。有极少数杂交种的新苗即使不缺磷也呈紫红色。还有一些杂交种就是在缺磷的状况下，幼芽也不体现紫红色症状。一般缺磷植株高度低于正常植株，这是判断杂交种玉米是否缺磷的主要方面。
正常苗颜色应该为绿色的玉米品系，幼芽颜色发紫，重要是.因为体内糖代谢受阻，叶子中积累的糖分较多，并因此产生大量的花青素苷，使植株带紫色。药害、虫害、种植管理不妥等不利于玉米苗成长、会使玉米苗体内糖代谢受阻的要素，都可能引起玉米苗颜色发紫，应查明起因，有针对性地采取救治方法。
