根霉菌学名为Rhizopusstolonifer，又叫黑根霉菌、旬枝根霉、黑色面包霉，属接合菌亚门，毛霉目，根霉属。是茯苓、灵芝、银耳、蘑菇等食用菌在菌种生产和栽培中的常见污染杂菌，分布范围广，适应性强。为害严重。
病原属于接合菌亚门真菌，主要是黑根霉，也有米根霉和华根霉。根霉菌丝无色透明，无隔膜，不长气生菌丝，只产生弧形的甸甸菌丝，称为假根。其孢子囊梗直立生长，不分枝，初期灰白色，后变为黄褐色或褐色，梗顶形成球形的孢子囊，孢子囊初为黄白色，成熟后变为黑色。孢囊孢子球形或近球形，大小7.5-20微米×5.5-13微米。
食用菌染病症状：培养基和培养料受害后，菌丝生长受到抑制，只有平贴基物表面匍匐生长菌丝，发生后期，在基物上形成许多圆球形的小颗粒体，发生初期为灰白色或黄白色，根霉分解淀粉能力强，待成熟后基质中呈黑色颗粒状霉层。
发病特点根霉菌主要生活在有机物上，其适应性强，成熟孢囊孢子通过空气和培养料等进行传播，在一定的温湿度下萌发生长，其没有气生菌丝，所以扩展速度慢。根霉属中温喜湿性杂菌，20-25℃下生长速度快。
防治方法：
1.选择合适的栽培场地，远离牲蓄粪等含有有机物的物质。
2.加强栽培管理，适时通风透气，保持适当的温湿度，清理周围废弃物，减少病源。
3.选用新鲜干燥无霉变的原料作培养料，在拌料时麦麸和米糠的用量比例控制在10%以内。
4.拌料时用干料重量的0.2%的25%或50%的多菌灵或干料重量0.2%的甲基托布津拌料。
