1.沤根黑豆喜湿，耐旱不耐涝，因此在齐垄栽培的基础上，应浇小水，避免田间积水，导致根系无法呼吸，而引起植株死亡。
防治措施：应避免大水漫灌，如有大雨时应及时排涝，晴天后有条件的可做适当划锄。以增加土壤通透性，提高根系活力。
2.疫病主要为害茎蔓，有时叶片和豆荚也受为害，在茎基部缢缩，导致上部萎蔫，枯死，湿度大时病部产生白色菌丝体，通常通风不良和土壤湿度大时容易发病。
防治措施：可用72%的杜邦克露500倍或72.2%的普力克800倍进行喷施，也可以用69%的安克锰锌1000倍喷施。7～10天一次，连喷2～3次。
3.枯萎病病菌多由毛细根入侵，病株叶片至下而上变黄，易脱落。根茎部有时产生裂痕。最后植株萎蔫枯死。剖开病部，可见维管束变褐色，严重的外部也会变褐色。湿度大时会产生粉红色霉层。此病多由于重茬或棚内湿度大而引起的。
防治措施：最有效地方法是在发病以前或发病初期用50%的DT500倍混加20%的甲基立枯磷1000倍灌根，7～10天一次，连续2～3次，一定要早防早治。
4.根腐病病株叶片上而下变黄，枯萎。叶片从叶缘开始黄枯，不易脱落，病株易拔出，茎基部及根部黑褐色，侧根脱落，主根腐烂，最后病株枯死。平畦种植，浇水过大，肥力不足，管理粗放的连作地发病重。
防治措施：在发病初期喷洒或浇灌恶霉灵1500倍液或根腐灵300倍，另外混用丰收一号800～1000倍灌根，7～10天一次，连续2～3次。
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