在种植香菇的过程中，病害是影响香菇品质和产量的重要因素，除了生理性病害以外，也需要特别注意香菇霉菌病害的防治。今日专家就香菇霉菌病害的综合防治进行详细介绍，供参考。
1、提供良好的发菌条件
许多菇农在进行香菇发菌培养时，往往采用蘑菇前期密闭发菌方法，以致造成严重的杂菌污染。香菇菌丝体培养阶段要求室内光线弱并阴凉通风，因此，生产菌棒数量应根据培养室面积大小决定，一般生产1000筒菌棒要求培养室面积15㎡左右。培养室过小，必然造成菌棒堆叠过紧过高，棒堆中因菌丝生长释放出的热量和水汽不易散失，从而极易引发大面积感染杂菌。在菌棒堆叠时，宜按“#”或“△”型堆叠，同时更应注意的是，不管接种洞口有否粘贴胶布(纸)，堆放菌棒时都要避免接种洞口被堆压。否则，必有大量的水汽在洞口凝聚，这样极易滋生杂菌。培养室通风条件较差的可安装排气扇，以加强通风。
2、改善环境因子、控制杂菌生长
杂菌发生快慢和轻重，在很大程度上取决于各种环境因子，特别是香菇栽培块或菌筒上的霉菌发生时应通风换气。温度、湿度等环境因子有利于香菇生长发育时，香菇菌丝生活力旺盛，抗性强，杂菌就不易发生，反之，杂菌便会乘虚而入，迅速发生。因此，在日常管理工作中，尽可能创造适宜于香菇生长发育的环境条件，这也是一项很重要的预防措施。如要防止木霉的污染，可把接种后的菌袋先在16℃下培养，这时香菇菌丝可以生长，而木霉的孢子难以萌发，菌丝生长缓慢（木霉菌丝生长最适温度为25—30℃），待香菇菌丝体在培养料表面生长到一定程度后，再逐步提高温度，最后在25℃下培养到菌丝体长满全袋。如一开始就在25℃下培养，有利木霉菌丝的生长，则杂菌污染率就高。
减少菌丝未愈合时发生霉菌，采取将门窗关好(定量开窗通风几次)，除去覆盖的薄膜，待控制霉菌后再盖上的措施。若个别栽培块发生霉菌，不要急于处理，待菌丝愈合后再作处理，但需增加掀动薄膜的次数，并加强栽培室通风换气和降温减湿。
霉菌发生在栽培块或菌筒表面，尚未入料，一般可以采用pH 8～10的石灰清水洗净上面的霉菌，改变酸碱度，抑制霉菌生长。若霉菌严重，已伸入料内，可把霉菌挖干净，然后补上栽培种。霉菌特别严重的栽培块或菌筒，可拿到室外，用清水把霉菌冲洗干净，晾干2～3天后，再喷洒0.5%过氧乙酸(CH3COOH)可收到显著的防治效果。
3、加强检查
在气温较高季节，培养室内菌袋排放不宜过高过密，以免因高温菌丝停止生长或烫伤，影响成品率。发菌5～6天后，结合翻堆要逐袋认真检查，发现污染菌袋随即取出。对污染轻的菌袋，可用20%甲醛或5%石碳酸或95%酒精注射于污染部位，再贴上消毒胶布。
对青霉、木霉污染严重的菌袋，添加适量新料后重新灭菌接种；污染链孢霉的菌袋，及时深埋。此外，要防鼠灭鼠，避免老鼠间接污染，对污染废弃的菌袋要集中处理，千万不能到处乱扔，以免造成重复感染。
4、搞好环境卫生
环境中广泛存在着杂菌孢子，且随着食用菌生产的发展，杂菌种群数量和孢子密度都相应激增。因此在进行袋栽香菇生产时，不但要抓好原辅材料的贮藏，还应搞好制种制棒场所及冷却室、接种室、培养室等场所的内外卫生，以减少杂菌侵染的机会。
使空气中杂菌孢子的密度降得最低，是减少杂菌污染最积极有效的一种方法。装瓶消毒冷却，接种、培养室等场所，均需做好日常的清洁卫生。暴雨后要进行集中打扫。坚持每天在空中、地面用0.2%肥皂水或3%～4%石碳酸水溶液，5%甲醛，1∶500倍50%的多菌灵水溶液及5%～20%石灰清水等交叉喷雾或喷洒，将废弃物和污染物及时烧毁或浸入药水缸，以防污染环境和空气。同时，还要加强对广大菇农群防意识教育，禁止随地乱扔已污染杂菌的废菌棒，对已污染的废菌棒应及时深埋或焚烧，防止杂菌污染环境。
