黑头病又叫细菌性褐斑病，是一种假单孢杆菌，属于裂殖菌门、裂殖菌纲。病菌呈杆状，形成白色菌落，革兰氏染色呈阴性反应。
该病害发病的内因是品种的不抗病性，外因是高温、高湿或喷洒不干净的水把细菌带到子实体上，如菌盖表面长时间有水滴或湿度过大极有利于该病害的发生，通风不畅能加剧病害的发展，中温条件适合发病。
1.保持菇场清洁卫生，及时清除病菇和废料；菇房、床架、用具等用前要用1：50倍的金星消毒液或2%的漂白粉等彻底消毒，尤其是原发病害较重的菇棚。
2.拌料时应将疣霉净按1：1000倍比例兑水拌料，不可用高毒、高残留的防污剂之类，以确保生产效果。
3.金针菇栽培时培养料应彻底灭菌，蘑菇和平菇栽培时培养料应充分发酵，腐熟均匀，覆土材料用甲醛熏蒸消毒即可。
4.金针菇出菇期控制出菇室温度在15℃以下，避开高温、高湿季节出菇，高温时加强通风散热，平菇出菇期温度不要超过18℃，如果气温突然升高，要采取降温措施，如开窗、揭膜、遮阴等，但要注意菇房内温度波动不能过大，防止水汽凝结，产生水膜。
5.发现病菇要及时摘除，并立即加大通风量，暂停或减少喷水，迅速降低温度，并用药控制病害，如可向料面喷洒5%的石灰水清液，也可喷洒每毫升100~200单位的链霉素液或300单位的土霉素，或500~1000倍的漂白粉液，每2天1次，施药前后菇床停水1天，间隔3~4天再次用药，连续用3次以上，能有效控制病害蔓延。发病严重时，应先清除病菇，清理料面或覆土后再按上述方法喷药。
