一、“食用菌菌种退化”的原因
1、培养环境
食用菌的生长环境包括：温度、湿度、光照、氧气，其中能够引起“食用菌菌种退化”的环境因素主要是温度，这是因为温度对生物代谢的影响最大，当处于极度不适的温度环境中，菌种的遗传特性发生改变，丧失了应该具有的优良生产性状，母种培养、保藏、运输时，遭受高温、低温（比如零下），都极易引起“食用菌菌种退化”。
2、培养基
培养基不适合菌种生长，会引起“食用菌菌种退化”，包括：培养基的营养构成、pH值、培养基过于丰富、培养基过于贫瘠，或者理解为培养基不适合其生长。关于食用菌母种培养基，现有理论和教科书远远滞后于实际生产，所谓贫瘠与丰富培养基交替等理论，都是套用微生物学的理论和概念，在食用菌工厂化生产中并没有实际的指导意义。
3、转代次数
转代次数过多，从微生物理论基础上分析，转代次数过多是容易出现“食用菌菌种退化”的，但是在实际食用菌生产中，应该是：采用不正确的菌种制作和培养的转代，容易引起“食用菌菌种退化”，转代的次数越多，引起“食用菌菌种退化” 的可能性就越大。
4、粉孢子、节孢子和分生孢子
对于在母种菌丝阶段，能够产生粉孢子、节孢子和分生孢子的品种，容易出现“食用菌菌种退化”，粉孢子等在条件合适的时候会萌发出菌丝，这些菌丝是不具有结实能力的，或者说结实能力很差。继续转代后，和正常的菌丝互相混合在一起，整体从菌丝的外观有可能没有任何的表现，但是最后会影响到最终的产量和质量。
5、菌种保藏
食用菌生产离不开菌种保藏，菌种保藏的方法不当，保藏的时间过长，保藏温度过高、过低，都会可能会引起“食用菌菌种退化”，特别是在保藏期间，斜面母种出现子实体，子实体虽然不会长得很大，但是只要有菌盖形成，就可能有孢子弹射到斜面上，条件合适就会萌发出菌丝，形成无性繁殖和有性繁殖混在一起的情况，造成“食用菌菌种退化”。
二、如何避免食用菌菌种退化
针对上述“食用菌菌种退化”的几点原因，为菌种生长提供合适的生长环境、合适的培养基、尽量降低转代次数、减少粉孢子、减少节孢子、减少分生孢子、做好菌种保藏，就能够尽最大程度的避免“食用菌菌种退化”。
总而言之一句话，按照正规的、严谨的技术要求进行菌种生产制作，是避免“食用菌菌种退化”的根本方法，一旦出现菌种退化，要及时的更换菌种。
