阴天，光照不足，菇棚内相对湿度大，在通风不良的情况下，平菇极容易发生软腐病、细菌斑点病两种并发症。
软腐病是一种真菌性病，其病原体为树枝状轮抱霉菌，属于半知菌纲，丛梗抱目，丛梗抱科。其分生孢子寄生于平菇宿主，出现色菌丝，并迅速蔓延，呈水红色。平菇于实体染病后变为褐色，最后腐烂。用手攥有大量黄褐色水流粘液，腥臭味。此病发病速度快，流行范围广，不及时防治，可造成毁灭性灾害。
细菌斑点病是一种细菌性病，其病原体为托布兰氏假单抱杆菌，主要危害平菇，此病只限菌益，菌益表面有水滴凝结时易发生。染病后平菇菌益呈暗褐色凹陷斑点，斑点干后，菌盖裂开，形成不规则子实体。此病直接影响平菇的产量和质量，减少菇农收入。
那么怎样才能防治这种并发病呢?根据我们的实践经验，特向菇农介绍以下综合防治方法。
1.选育抗病品种，培育健壮菌丝，提高平菇抗病力。如：河北无孢子、江苏野风等，菌丝生长雪白，子实体抗病力强，产量高。
2.增大通风量，净化空气环境。
3.采用阴沟补水方法，维持菇棚相对湿度在65％。
4.进行菇棚消毒。白友粉撒于棚壁和棚地，既经济，消毒杀菌效果又好，不妨一试。
5.药物治疗配方(1)农用链霉素250万单位50％克霉灵，10克绿风9550毫升，水14公斤(2)农用链霉素250万单位，绿风9550毫升，绿芬威1号17克，水14公斤.
方义：链霉素是广谱杀菌剂，可杀灭多种细菌，克霉灵对真菌有很好的抑制和杀灭作用。二药同用，功能相济，提高抑制，杀灭杂菌功效。绿风95调节代谢，促进生长，绿芬威1号为营养补品，诸药按上方配伍，既增强平菇抗性，又杀灭寄生细菌和真菌，达到药到病除之功效。方法：如上配方任选其一配制混合药液，子实体和菌面喷雾，每日一次，以子实体不滴落药液为宜。一般两次见效，三次痊愈。在喷药期间，禁止子实体喷水。
