一、病虫害的侵染途径
1.自然传播
在食用菌制种和栽培过程中，稍有疏忽病菌孢子就会侵入菌种和培养袋，而害虫则潜伏在菇房周围的废料、杂草和枯枝落叶中，发育产卵繁殖，严重危害食用菌生产。
2.种子带菌
使用的母种、原种或栽培种，未经严格检查，混有杂菌和虫害，用菌种来生产，导致全部侵染。
二、病害及其防治
1.真菌性病害
①褐腐病又叫草疣孢霉，是阿魏菇和其它食用菌最为常见的病，只感染子实体，不感染菌丝体，子实体受害后变褐色，菇体畸形、溃烂，有臭味。
防治措施：常压消毒培养袋，灭菌要彻底，覆土用1∶500多菌灵或苯菌灵、敌克多等喷洒处理。
②链孢霉俗称红色面包霉，是污染菌种和菇房的重要病害。霉菌丝初为白色绒毛状，后逐渐变为桔黄色粉粒状，最适温度为23℃。
防治措施：搞好接种室、菇房及周围的环境卫生；制菌种的培养料灭菌要彻底；降低菇房温度和湿度，加强通风换气；在料内加入0.1%多菌灵拌种，或加入1%石灰，如发现此霉菌勿用喷雾器喷药防治，应远离菇房埋掉。
③木霉危害多种食用菌，抑制食用菌的生长，霉菌初为白色棉絮状，产生孢子后，逐渐变绿色，最后呈墨绿色。
防治措施：用1%石灰加0.2%多菌灵拌料。点片发生时，将霉点去掉，用石灰或浓石灰水覆盖发病部位。菌床上喷洒0.2%多菌灵、克霉灵或代森锌。
2.细菌性病害
①细菌斑点病由假单孢菌引起，菌盖上有小的黄色或苍褐色区，后变成凹陷斑点，斑点干后菌盖裂开，形成不对称子实体，菌盖上积水易发生斑点病。
防治措施：菌盖表面不积水，防止培养料过湿；菇房湿度保持在85%以下；喷1∶600倍的漂白粉液。
②菌褶滴水病由假单孢菌引起，主要侵染菌褶，被感染部位变成奶油色小液滴，最后菌褶烂掉，变成褐色粘液团。
防治措施：同细菌斑点病。
三、虫害及其防治
1.菌蝇
成虫是很小的蝇子，幼虫为蛆，白色或米黄色，以幼虫危害菌丝体和子实体，严重时可把菌丝全部咬断，料变黑发粘，有臭味。
防治措施：菌蝇多从菇房外飞入，要搞好环境卫生，菇房门、窗装纱窗，阻止成虫飞进；每平方米用除虫菊1克，加草木灰，撒在地面、墙角和走道间，连撒2～3天，效果较好。在菇袋入棚前，菇棚每立方米空间用1克高锰酸钾加100毫升甲醛熏蒸，或用硫磺粉（50米大棚用15千克），燃烧熏棚48小时，在熏棚前地面洒石灰粉，后用喷雾器喷洒200毫升的敌敌畏熏蒸后可杀死螨类、菌蝇、菌蚊、跳虫等害虫。
2.菌蚊
个体很小，成虫似蚊，为黑色，幼虫为蛆，以幼虫危害子实体和菌丝体。
防治方法：同菌蝇。
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