猴头菇工厂化出菇的栽培模式有倒置栽培模式、侧面割口栽培模式、筐栽模式、瓶栽模式和网格栽培模式5种方式。
1.倒置栽培模式
在生长发育时，猴头菇的菌刺朝向重力方向生长，将袋口朝下会使猴头菇的菌刺全部竖立，商品形状更加美观，更像“猴头”，实际栽培中发现，菌包袋头向下需要专门的高密度网格，并且加湿器产生的冷凝水容易流到猴头菇子实体上，导致细菌污染等问题，影响猴头菇的商品形状。
2.侧面割口模式
我国北方地区农户栽培猴头菇较多采用侧面割口方式，但在实际工厂化栽培中发现，培养过程中菌包相对湿度处于65%～70%的范围中，袋口的菌种不会因失水而干燥死亡，所以袋口还会继续长出猴头菇子实体，并且侧面出菇占用面积大，不易上架、采收，所以侧面割口模式不适合猴头菇工厂化栽培。
3.筐栽模式
直接将装有菌包的周转筐竖立放置于出菇床架上，该方式与网格栽培模式相仿，焊制专门摆放周转筐的床架即可实现，但占用周转筐时间较长，增加了固定投资。
4.瓶栽模式
使用瓶栽模式在培养阶段可实现高度的自动化，但在出菇阶段，瓶口直接出菇会导致原基过多，形成大量的小猴头菇，商品性状差，经济效益低；另外，使用定制的小口瓶盖出菇，虽然能减少原基数量，但与塑料袋口直接出菇相比原基还是较多，也增加了操作工序及投资成本。
5.网格栽培模式
实际生产表明，网格栽培模式是最适合猴头菇出菇的一种模式，环境条件控制均匀，操作较为简单，还可根据现有设施设备情况增加或减少摆放密度。
