鸡腿蘑在生产中存在的一个难题是长菇期发生“鸡爪菌”，严重危害鸡腿蘑正常生长，致使大面积减产，甚至绝收，给栽培者带来经济损失，被菇农称之为“癌症”。
一、鸡爪菌形态与病因
1、形态特征：鸡爪菌属于竞争性的杂菌，是一种蕈状芽孢秆菌寄生鸡腿蘑菌丝体上，与鸡腿蘑菌丝争夺营养分，然后转入生殖生长，产出形状似鸡爪的子实体而得名。鸡爪菌的菌丝初期灰白色，后形成索状向料层伸展，然后爬上料面产生原基并发育成鸡爪状长于土层表面。鸡爪菌子实体初期为浅褐色或棕红色，内部白色木质化，闻有异味。
2、病因与危害：鸡爪菌原生于土壤腐殖层，子实体成熟后撒发担孢子，随着空气、土壤、水、堆肥以及昆虫等方式传播。在温度20-30℃时容易发作，夏秋季节孢子大量萌发，传播很快。
鸡腿蘑生产过程，在前期菌丝生长阶段，发生鸡爪菌侵袭时，养分受到破坏，影响正常生长；后期随着鸡爪菌的菌丝蔓延，分泌出一种有害的胞外酶，蚀袭鸡腿蘑菌丝，使菌丝逐步萎缩，无法转入发殖生长，以致不出菇。
二、防治鸡爪菌发生措施
1、忧化场地，堵绝病原菌“三强调”栽培场地包括土壤、杂草、垃圾等是鸡爪菌繁殖的地方。要堵绝污染源就要“三强调”：
（1）强调水旱轮作：一年种农作物，一年种菇；
（2）强调环境卫生：提前清除周围杂草垃圾与废料；
（3）强调消毒灭菌：场地翻土晒白，用石灰水喷洒消毒。
2、科学配料，杀灭潜存害菌“三必须”
鸡腿蘑是采取棉籽壳、玉米芯、蔗渣等为原料。而这些原料中本身附着害菌孢子，要根绝就得“三必须”：
（1）必须选料曝晒：选择无霉烂变质的原料，并经曝晒1-2天，利用阳光紫外线杀灭害菌孢子；
（2）必须配方合理：掌握原料（棉籽壳或玉米芯等）占85%，麦麸10%，石灰粉3%，石膏粉1%，复合肥1%，加水110%，PH7-8；
（3）必须堆料发酵：发酵是杀灭鸡爪菌的一种有效手段，将原料加水拌匀后，堆集发酵2-3天。当料温上升至65℃后进行翻堆3-4次，达到料色棕褐，呈现大量放线菌菌丝及孢子，有香味，PH7.5为宜。
3、育好母体，以强制弱“四要求”
现有鸡肥蘑栽培载体是发酵料袋栽。为根绝鸡爪菌，采取育好母体以强制弱，为此严格执行“四要求”：
（1）料袋灭菌要求上100℃后持续4-6小时；
（2）接种要求无菌操作，防止“病从口入”；
（3）菌袋培养室要求事前消毒杀菌，可用气雾消毒盒或硫磺熏烟消毒；
（4）培养生态要求温度23-25℃，不超28℃，室内干燥，避光，注意通风，压制病菌发作。
4、讲究覆土、强化消毒“四注意”
鸡腿蘑不覆土就不出菇，但土壤中病源菌较多，为此必须“四注意”：
（1）注意选土：选择没发生过鸡爪菌地方的土壤作为覆土材料；
（2）注意消毒：覆土材料曝晒2-3天后，再用2%石灰粉拌匀消毒；
（3）注意灭菌：将覆土材料集堆后，打入蒸汽，当土温上升65℃时，保持1-2天，然后打散排除废气；
（4）注意土质含水量，上述处理好的覆土材料，土壤含水量掌握不超25%。
5、出菇管理，营造环境“五控制”
鸡腿蘑出菇阶段也是鸡爪菌子实体发作时期，为此必须采取“五控制”：
（1）控制水源污染：长菇期喷水禁用池塘水，沟水等含污染水质；喷水增湿空间相对湿度不超过95%，以防害菌孳生；
（2）控制光照度：菇棚光线以500-1000勒克斯散射光；
（3）控制有害气体：长菇期加强通风，保持菇棚风空气流畅；
（4）控制害菌混生：一旦发现鸡爪菌迹象立即把菌丝连同培养料一起挖出远离菇房，并在患处撒上石灰粉，防止蔓延，或采用“鸡爪菌立灭王”药剂杀灭；
（5）控制成熟期：一般覆土后10-15天菇蕾大量发生，当菌柄抽长，菌盖饱满时即可采收，防止过熟霉烂引起鸡爪菌侵蚀。
