幸福菇的菌种分为母种（一级）、原种（二级）、栽培种（三级）。
一、母种制作
首先将母种的培养基制作好，配方为：马铃薯200克，琼脂20克，葡萄糖20克，水1000毫升。制作时，先将土豆去皮切片后，置容器内，加水1000毫升，加热煮沸30分钟，将土豆片捞出，用双层纱布过滤，滤液中再加入琼脂，不断搅拌，待琼脂溶解后，分装试管，装量为试管长度2/5左右，按常规塞好棉塞，在高压锅内灭菌30分钟左右。常压锅灭菌60分钟左右，开锅将试管培养基在平台上摆置成斜面。冷却两天后，然后选择无病害、形体美观、健壮的菌株进行消毒，从中取一块菌肉，放入试管中培养基上，塞好棉塞。（此操作在无菌箱或无菌室进行），待七天后长满菌丝为母种。
二、原种、栽培种制作
1、选料：选择无霉烂、新鲜棉子壳或小麦、玉米做培养基，凡是用谷粒做培养基都要进行浸泡、煮沸。
2、配方：棉子壳78%，麦麸20%，石膏粉1%，水60公斤，PH5-7。
3、拌料：将棉子壳、麦麸、石膏粉加水搅拌均匀，使培养基含水量65%，PH7.5。
4、装瓶：选择750毫升的菌种或菌种专用袋，装瓶要求松紧一致，培养料装至瓶肩，扎好瓶口或系好袋口。
5、灭菌：装好瓶要及时灭菌，一般高压锅灭菌3小时，常压锅灭菌8-10小时。
6、接种：灭好菌的瓶，冷却后运到接种箱或无菌操作台进行接种，接种前要将工具、手严格消毒，接种箱用烟雾剂灭菌40分钟，再进行接种。
7、培养：接种好的菌种放入培养室进行培养，保持培养室温度25℃，一个月后就可栽培。
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