（1）种芝选择
生产中，一般选用无病虫害的6-7分成熟的鲜芝做种芝。种芝表面可经紫外照射消毒、酒精擦拭消毒。
（2）组织分离
组织分离之前，先用酒精棉球擦拭种芝的表面，再将菌盖撕开，一分为二。一般选择灵芝菌盖黄白色生长区菌肉组织或者灵芝菌柄上方菌盖中部的菌肉组织为取种部位。组织分离时，可先用无菌手术刀小心切割灵芝菌肉，然后用接种针取5毫米x5毫米的小块菌肉组织，接入试管培养基中上部表面。
（3）培养
将上述分离物置于生化培养箱中培养。
调温至28-30℃，避光培养。经过2-3天，菌肉组织既可开始萌发，出现肉眼可见的菌丝体，并在培养基表面逐渐蔓延。一般7-10天可长满试管斜面。如果分离物（菌肉组织）不到2天就出现肉眼可见的菌丝体，多是杂菌。如果分离物（菌肉组织）培养4天仍为出现肉眼可见的菌丝体，可能是切割灵芝菌肉组织的手术刀或接种针在酒精火焰上方灼烧之后没有充分冷却，或者其它原因导致分离物（菌肉组织）失去活性而不能萌发菌丝体。
灵芝菌丝体洁白、纤细、平坦、致密、均匀，随着菌丝的生长、菌落的扩展，接种块处的菌丝逐渐老化形成坚韧的菌皮，并随着菌皮的老化，色泽逐渐变为淡黄色。
（4）质量要求
挑选灵芝菌丝体生长整齐，长速正常，菌丝外观饱满，长势旺盛，气生菌丝洁白、纤细、平坦、致密、均匀的分离物作为备用菌种。
