春季银耳栽培大多数是绿霉为害，也有部分根霉、毛霉污染，而链孢霉极少。绿霉、毛霉、根霉常发生在菌袋接种穴边，或接种后９－10天两穴菌圈接头时，在菌丝前端出现，也有在袋壁出现。绿霉也发生在子实体上。使耳片霉烂。链孢霉多发生在袋口扎缝隙。造成污染原因主要由于料袋灭菌不彻底，无菌操作不严，袋膜破孔，菌种不纯带染或环境污染受害等。
一、避免杂菌污染，关键做好以下几方面：
1、净化菇房环境：经常清理环境卫生，并撒石灰粉消毒：房内栽培前严格消毒杀菌，杜绝污染源。
2、精选原辅料：棉籽壳、麦麸要求无结块、无霉烂变质，并置于烈日曝晒杀菌，栽培袋事前检测质量。
3、规范菌袋生产：培养料含水鼍掌握不超60％，装袋上灶时限不超6小时，防止料变酸。灭菌要求上100℃保持24小时，中途不降温。
5、坚持无菌操作：接种室彻底消毒灭菌，选用合格消毒剂，可用超强型洁净精，每袋加水10－20千克，喷洒空间和架床、场地，然后用消毒盒每立方米不少于5克，灭菌时间1小时。接种要求过精酒灯火焰。
5、菌种严格把关。精选菌种，春季银耳菌种要求香灰菌丝强些，避免接种后遇低温退灰影响长耳。抄菌注意按种箱消毒，运菌防止破瓶脱塞。
6、污染袋处理：受杂菌危害的污染袋应区别处理：轻度污染采取套袋扎口，控制蔓延，再灭菌接种；重者破袋取料，加1－2％石灰拌匀，闷24小时后摊晒，用于下次再利用栽培。子实体被绿霉污染，应提前采收，并用PH8石灰上液清液涂擦耳基，控制蔓延。
