1、培养环境
温度、湿度、光照、氧气构成了食用菌生长环境，其中引起退化的最主要环境因素为温度，因为温度对生物代谢的影响最大，当菌种处于极度不适的温度环境中，菌种的遗传特性就会发生改变，丧失了应该具有的优良生产性状。
因此，母种培养、保藏、运输时，遭受高温、低温（比如零下）都极易引起菌种退化。
2、培养基
培养基的营养构成、pH值、培养基过于丰富或贫瘠都可能导致菌种退化。关于食用菌母种培养基，现有理论和教科书远远滞后于实际生产，所谓贫瘠与丰富培养基交替等理论，都是套用微生物学的理论和概念，在食用菌工厂化生产中并没有实际的指导意义。
3、转代次数
采用不正确的菌种制作和培养转代，容易引起菌种退化，转代的次数越多，引起“食用菌菌种退化” 的可能性就越大。
4、粉孢子、节孢子和分生孢子
对于在母种菌丝阶段，能够产生粉孢子、节孢子和分生孢子的品种，容易出现菌种退化，粉孢子等在条件适宜的时候会萌发出菌丝，这些菌丝是不具有结实能力的，或者说结实能力很差。继续转代后，和正常的菌丝互相混合在一起，整体从菌丝的外观有可能没有任何的表现，但是最后会影响到最终的产量和质量。
5、菌种保藏
菌种保藏的方法不当，保藏的时间过长，保藏温度过高或者过低，都可能会导致菌种退化，特别是在保藏期间，斜面母种出现子实体，子实体虽然不会长得很大，但是只要有菌盖形成，就可能有孢子弹射到斜面上，条件合适就会萌发出菌丝，形成无性繁殖和有性繁殖混在一起的情况，造成菌种退化。
" alt="食用菌知识 | 肉苁蓉与灵芝泡酒，养生好搭档！">
" alt="食用菌加工贮藏 | 灵芝黄芪酒加工步骤">
" alt="食用菌栽培种植 | 优劣平菇菌种分别具有什么特征？">
" alt="食用菌栽培种植 | 检查食用菌母种要细心">
" alt="食用菌栽培种植 | “金海A1”香菇新品种特性">
" alt="食用菌病虫害 | 鲍鱼菇病虫防治">
" alt="食用菌菜谱 | 菌菇肉酱">
" alt="食用菌栽培种植 | 香菇高产接种方法">
" alt="食用菌病虫害 | 怎样防治食用菌螨虫">
" alt="食用菌加工贮藏 | 菌种土法贮藏">
" alt="食用菌栽培种植 | 天麻萌发菌菌种制作技术">
" alt="食用菌基地 | 河北秦皇岛：小小银耳绽放致富花">
" alt="食用菌病虫害 | 农药在食用菌行业使用时应该做到哪些">
" alt="食用菌加工贮藏 | 香菇干燥方法">
" alt="食用菌栽培种植 | 食用菌液体菌种接种方法">
" alt="食用菌栽培种植 | 不同食用菌种类的液体菌种发酵种配方">
" alt="食用菌加工贮藏 | 食用菌贮藏保鲜设备与相关技术">
" alt="食用菌栽培种植 | 获得银耳菌种的方法">
" alt="食用菌栽培种植 | 草菇菌种的生产质量要求">
" alt="食用菌栽培种植 | 大棚种蘑菇消毒需注意">
" alt="如何自己种金针菇？">
" alt="庆元菇棚套种杨树 一举解双愁">
" alt="双孢菇栽培技术讲解">
" alt="香菇种植在出菇前需做好这四个步骤，还不知道的赶紧看看！">
" alt="吃蘑菇的要注意什么?">