一、接种时间晚
到4月份才开始接种为时已晚，因天气已转暖易感染杂菌。2-3月接种最好，因食用菌菌丝5℃以上时开始萌发生长，而霉菌则需15℃以上才大量发生。因此，要安排早接种采用低温发菌，可渡过霉菌感染关。
二、培养基混入松树锯末
因松树锯末含有杀菌物质，可抑制滑菇菌丝生长，菌丝不吃料，致后期杂菌大量发生而失败。
三、菌种老化
最适合的菌龄是从接种开始40-50左右的菌种。已老化的菌种，菌丝体已成熟，菌丝生长慢，后期易感染杂菌。早期生产的菌种，应贮于4℃以下，让菌丝休眠，才可防止不老化。
四、室内无菌操作不严格
农村栽培滑菇无固定接种室，多在住宅接种，污染机会多，因此要严格执行无菌操作。如接种室及菇房要彻底消毒，墙壁及大棚要涂白（用白灰刷1次），所有用具及塑料蒲膜要用3％来苏儿浸泡。工作人员穿消毒白大褂，戴帽子（掩住头发）、口罩，先洗净双手，操作前再用75％酒精棉球擦手，接种时不允许其他人出入，更不宜吸烟、吐痰或交谈。上架以后室内定期喷3％波尔多液。
五、接种量偏少
正常情况培养料和菌种比例为10∶1。如果接种量偏少，菌丝生长慢，易感染杂菌。适当增加用种量如10∶1.5或10∶2，则很少感染杂菌。
六、蒸料和接种不同步
有的菇农先集中蒸料，数天后集中接种，这样造成污染机会增多。正确做法是：趁热出料包装或装袋，在室内降温，当天接种，不可延至次日。
七、老菇房隐患大
老菇房杂菌孢子多，极易造成杂菌感染。因此，栽培前重新消毒刷白１次，用两种消毒药交叉消毒。
八、糠（麸）和锯末比例失调
配料时糠、麸不应超过20％，否则透气不良易酸败感染杂菌。另外，糠、麸要新鲜，酸败的发霉的不能用。
九、环境污染
周围环境不洁，杂菌孢子多，造成感染严重。栽培场要选择空气新鲜、通气良好的地方，附近不宜有大粪场、禽畜舍，垃圾堆等。
十、菌块太厚
培养基厚以8厘米为宜，即装料10厘米压缩到8厘米，菌块厚菌丝长满培养基时间延长，杂菌感染率高。
十一、用旧塑料膜
用过一次的旧膜，特别是受过霉菌污染的旧膜感染率高。如用旧膜时，要先用碱水冲洗再用3％来苏儿液浸一昼夜，捞出抖掉水珠再用。
十二、菇房湿度大
菌丝生长时室内相对湿度不宜超过70％，即宜干不宜湿。而出菇时需湿度大，湿度大可加强通风，室内放生石灰吸潮。
十三、菌块水分大
滑菇培养料湿度不宜超过65％，水分大菌丝生长慢。如菌丝已穿透1厘米，因底部水分大（料湿度大含水多）菌丝不长时，可将菌块翻过来，菌丝可继续生长。
十四、阳光直射菌块
培养基上架培养菌丝要避光，室内有散射光即可，如阳光直射菌块，菌丝生长会受抑制。因此，要避光培养，不可使日光照到菌块上。
十五、通风有死角
菌丝生长需要氧气，发菌期通风良好，可使菌丝迅速生长，提前长满培养基。因此，建菇房时南北窗要均等，窗口要大，与地面平齐建地窗，房顶要设拔风筒。
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