规模化栽培场所环境卫生的处理和控制非常重要。环境卫生是有效防治食用菌病虫害的重要手段，也是其他防治技术的基础。做好菇场日常清洁卫生工作，将废弃物和污染物及时烧毁或深埋，及时清理周边环境中的杂草、积水及各种有机残体，避免病虫滋生，避免使用不清洁的污水，有条件的可撒些石灰保持菇房周围干燥，特别是上一年废料，一定要在种菇前2个月烧毁或深埋。对发病严重的老栽培菇房要进行熏蒸，消毒。方法是10g福尔马林倒入高锰酸钾5g/m3中进行熏蒸，装高锰酸钾的容器要深，容积比福尔马林大10倍以上；熏蒸时要密闭栽培室，2d后打开门窗通风换气24h再装菌袋送入。也可用硫磺熏，用量为35g/m3，密闭48h后，再过2d进料。
规模化栽培严把菌种生产关也是病虫害防止的关键。菌种首先要优良，无任何病虫害侵染，营养也要充足，菌丝健壮，适龄。
熟料栽培要严格按照无菌操作程序进行接种。接种室要严格消毒，紫外灯与气雾消毒剂要配合使用，尽量杀灭接种空间的杂菌数目。接种人员进人接种室前要换工作服、戴工作帽、穿工作鞋。接种前做好菌种的预处理，手要用75%的酒精消毒，接种工具用火焰灭菌；接种时，菌种瓶用酒精灯火焰封口，动作要迅速，菌种量应适中；接种时要避免人员走动和交谈，瓶盖或袋的棉塞等杂物应放指定处；接种后应及时打扫卫生、保持室内清洁。杂菌感染袋不能随便丢弃，要重新灭菌后改变用途或掩埋。保证生产使用的菌种纯洁无污染。
改进栽培管理措施。
科学用水，及时通风，调节好温度、光照。忌用不干净的水，子实体形成阶段，忌往菇床上大量喷水。菇房要定期通风，防止C02浓度过高，引起生理性病害。适当降温培养，虽然食用菌生长速度较慢，但病虫害会明显减少。
及时清除残菇。采菇后彻底清理料面，将菇根、水兰菇及被害菇蕾摘除捡出，集中深埋或烧掉，不可随意扔放，
用于覆土栽培的品种，覆土材料要先暴晒，而后打碎过筛，要经过高温或药剂处理，将病虫害杀死，再用1%石灰水调湿备用。
改善栽培设施，防止杂菌、病虫的入侵 菇房门窗安装60目防虫网、纱窗等，在菇房的进出口保持十几米黑暗，或设置缓冲门，注意随时关灯，出入菇房随手关门，防止成虫趋光飞入产卵。
长期使用同一栽培场地的地栽食用菌，病虫害基数大，对于发生过严重性病害、虫害的出菇棚或栽培场所应采取换茬或轮作的方法，定期转换严格消毒，避免病虫害再次暴发。
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