香菇在生长发育中常会受到病虫害的侵害，防治病虫害对香菇栽培十分重要，不及时治疗，轻则造成减产，重则栽培失败，所以防治工作不容忽视。香菇的病虫害防治应以“预防为主，综合治理”和“安全、有效、经济”的原则，用农业防治、生物防治、物理防治和化学防治相结合的综合防治技术对有害生物进行控制和治理，把化学防治作为辅助手段，使生产的香菇达到国家无公害香菇质量标准。
香菇的病虫害包括杂菌害、虫害、病害三大类。一旦发生病虫害，要认真分析，确定病因，及时采取措施防治，防止扩大传播，把损失降到最低程度。
一、杂菌危害
（一）杂菌种类
生长在香菇上的杂菌很多，主要有木霉、青霉、毛霉等。
1、木霉：木霉又称为绿霉菌，广泛分布于各种植物残体、土壤和空气中侵入培养基内，在适宜的条件下就萌发繁殖为害。木霉适应性强，繁殖速度快，它本身能分泌毒素，抑制香菇菌丝生长。木霉在4-42℃范围内都能生长，孢子萌发喜高湿环境，侵害香菇培养基时，初期为白色棉絮状，后期变为绿色。菌种如果被木霉危害，必须报废，即使轻度感病的菌种也应弃之不惜。
2、链霉：又叫链孢霉，生长初期呈绒毛状，白色或灰色，生长后期呈粉红色或黄色。大量分生孢子堆集成团时，外观与猴头菌子实体相似，链孢霉主要以分生孢子传播为害，是高温季节发生的最重要杂菌。
3、毛霉：又叫黑霉、长毛霉，菌丝初期白色，后灰白色至黑色，该菌在土壤、粪便、禾草及空气中到处存在。在温度较高、湿度大、通风不良的条件下发生率高，生长速度明显高于香菇菌丝，毛霉菌丝体每日可延伸3厘米左右。发生的主要原因是基质中使用了霉变的原料，接种环境含毛霉孢子多，在闷湿环境中进行菌丝培养等等。
（二）杂菌防治
1、培养料必须先经堆制发酵，利用多种高温型微生物所产生的生物热杀死害虫和中低温菌类，减少污染源。
2、快速装袋灭菌。配制后的培养偏酸性，适于各种微生物生长与繁殖，所以应尽量在5小时内装完毕，灭菌时要求在4-6小时使温度上升到100℃。
3、培养室降温、通风，可以减少杂菌污染，提高接种成品率。如要防止木霉的污染，可把接种后的菌袋先在16℃下培养，这时香菇菌丝可以生长，而木霉的孢子难以萌发，菌丝生长缓慢（木霉菌丝生长最适温度为25-30℃），待香菇菌丝体在培养料表面生长到一定程度后，再逐步提高温度，最后在25℃下培养到菌丝体长满全袋。如一开始就在25℃下培养，有利木霉菌丝的生长，则杂菌污染率就高。
4、局部污染的菌袋，可注射20%甲醛溶液或5%石碳酸，以控制污染点的扩散。
