在中国数千年的历史中，关于灵芝的种种神奇传说源源流淌、绵延不绝。灵芝的神秘色彩、环绕它的扑朔迷离的光环，仅从其诸多的近乎玄秘的称谓即可略见一斑。上古时期称为"瑶草"、《楚词.九歌.山鬼》称为"三秀"、《尔雅》称为"瑞草"（明代李时珍也说："古人皆以为瑞草"）、《神农本草》称为"神芝"、秦始皇时代称为"还阳草"、东汉张衡的《西京赋》称为"灵草"的均是指灵芝。"灵芝"这一如今家喻户晓的称谓，在药学着作中始见于《滇南本草》，"灵芝"初见载籍则是三国大文学家曹植的《灵芝篇》，在明代"灵芝"这一称谓就已固定下来，《西游记》及《本草纲目》中都有据可考。
“武夷彭祖”与灵芝
武夷山位于福建省武夷山脉北段东南麓，面积70平方公里。相传唐尧时代的长寿老翁彭祖隐于此山。彭祖生有二子，长曰「武」， 次曰「夷」，二人开山挖河，疏干洪水，后人为纪念他们，就把此山称为「武夷山」。
彭祖是黄帝后代颛顼的玄孙，因为他常服食武夷山“灵芝仙草”，故活了760年仍然貌似童颜、不见衰老。后人史称他的养生之道是“茹芝饮瀑，遁迹养生”。武夷山灵芝也因此而闻名。
“嫦娥”食灵芝奔月
传说后羿射下九个太阳，挽救了天下苍生，王母娘娘便赐灵芝长生不老药给后羿，却被后羿妻子嫦娥偷吃，结果嫦娥“轻身”轻飘飘的奔向月亮过她的“不老、延年神仙”的生活。
“秦始皇”蓬莱寻灵芝
传说秦始皇为求长生不老，派徐福率领三千童男童女到东海瀛洲采摘灵芝仙草。徐福第一次出海归来后，说他已经登上了蓬莱仙山，看到了仙药，但山上的大神嫌他带的礼物太少，没让他将仙药带走，说要得到仙药，必须选送优秀的男女和工匠来。秦始皇听说徐福见到了仙药，非常高兴，马上选拔了三千童男童女和一批能工巧匠交给徐福，令徐福去求仙药。徐福在海上转了一阵子也没求得仙药，回来向秦始皇回禀说，这次没求得仙药是因为海上有蛟龙大鱼作崇，阻止船向仙山靠扰，要去仙山，还得配备优秀射手和先进武器。恰巧，这时秦始皇做了一个梦，梦见他与海神搏战，据占梦博士解释，这海神正是蛟龙大鱼的象征。于是，秦始皇相信了徐福的说法，又为他选配了射手和武器，并亲自下海前去。当船行到芝罘岛附近时，果然遇到一条大鱼，秦始皇亲自射杀了它，认为这下上仙山没有障碍了。谁知，神山、仙药还是没有找到，徐福再也不敢去见秦始皇，便带着三千童男童女和一批工匠去了日本，并在那里繁衍生存下来。最后，徐福死在日本的富士山麓。
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