由于烂筒的发生原因或病原菌不同，发生烂筒的表现症状亦不同，生产中多以木霉为病原，则多称“木霉病”等，实际生产中往往是木霉先行侵染、然后形成多菌交叉感染的情况居多。
一、香菇“烂筒病”发生的症状
在培菌阶段菌丝走菌缓慢，杂菌侵染而吞噬，造成菌筒变黑逐渐变软流黑水而烂筒；当菌筒菌丝基本走透后，发病首先从接种穴或表层局部的培养原基发生软化、腐烂并同时分泌黄水，继后黄水渐变为黑褐色至酱油色，烂口逐步扩大迅速蔓延，发生退菌和菌体自溶，表层变或棕黑色，呈软烂状，里层形成坚硬的皮层。随着烂筒程度的加深，菌筒内水溶物的增多，菌丝逐渐淡化变黄，以至菌丝全部解体，整个菌袋软化、腐烂发黑而松瘫。
二、烂筒的防治方法
使用香菇烂筒防治剂可以降低香菇花菇的烂筒率，但不是唯一方法，只有加强综合防治措施，才能从根本上解决香菇烂筒问题。下面就综合防治香菇烂筒阐述以下措施：
1、应选择抗逆性强的菌株 根据菌株特性合理安排生产。低温型品种适当提前接种期，培养料中的氮量配额适当增多，含水量一定要控制在50％以内；中温型品种不宜过早接种，应预防菌丝早衰、退化。
2、应慎重选择菇筒安全度夏的场所 菇筒安全度夏的条件是周围卫生环境良好，经营做好消毒与灭虫工作：堆放菇筒的房间应是通风良好凉爽干燥、避光低湿的房间，并定期观察房间的温、湿度变化，遇到高温、高湿的天气要及时降温、排湿，防止“烧菌”；排筒要合理。接种后先是“四四”堆叠，当菌丝直径长至3-4cm后应是“三三”堆叠，最后菌丝快长满菌筒“放大气”后，应是“二二”堆叠。若房间过于闷热，应将菌筒移至栽培场，在阴棚内掀膜安全度夏，严防烂料烧菌现象发生。
3、抓好刺孔通气管理关 刺孔通气是香菇的花菇生产管理的关键措施，它关系到花菇出菇的迟早(刺孔多、深、大，则出菇早、数量多、但朵形小)，产量的高低与品质的好坏(刺孔适时、深浅适中、数量合宜则产量高品质好)。故应当注意以下问题：
①刺孔时应选择晴天的早晚进行，遇闷热天气应加强通风。
②第一次刺孔是在菌丝的直径长至5cm时，开始“放小气”，即用经消毒后的竹尖在每个穴分布的菌丝内刺3—5个小孔，不可太深(不超过5mm)，也不可太边。每次竹尖均要用消毒药水消毒后再刺其他穴。对已发生污染的穴位均不可刺孔，避免交叉污染。
③第二次刺孔是在菌丝长满袋后10-20d后(可见有少量的原基形成)，用“放大气”方式进行，中温型品种应刺孔40—50个，低温型品种应刺50-60个孔，深不可超过3.5cm以上。另外也要根据菌袋中培养料的含水量，含水量多的应多刺并刺深，反之就相对少而浅些。
④“放大气”不宜太迟。一旦菌筒已出现部份或大量原基形成，放气太迟将导致烂料。放气后每三天对菌筒翻动一次，连续三次，每次按不同方向排列，使菌筒色泽一致。
4、搞好环境卫生整治关 ①对老菇区、老发菌场所、老菇棚特别应当注意更换场地，选择卫生、干净、通风、阴凉、避光、低湿的环境做发菌场所；②经常做好环境消毒与杀菌灭虫的工作。在选择农药时应特别注重经常更换常规使用的品种，防止产生抗药性。③对栽培的地畦用千分之一的“强氯精”消毒药水进行消毒，或用0.1％的香菇烂筒防治剂对菇筒进行喷洒消毒。
5、把好病虫害的防治关 ①每隔15-20d应在培菌室的地面与空间喷稀释200倍的敌敌畏与800倍的多菌灵，在消毒时室内应闭窗2-3h，消毒后应开窗通风(不可直接喷在菇筒上)；②在培养间的窗门应装有纱窗，在进出的门上挂有沾有敌敌畏的药棉。防止菇蚊、菇蝇飞入；③四周环境应经常撒上石灰粉与漂白粉，进行环境消毒；
6、使用香菇烂筒防治剂防治香菇烂筒 针对导致烂筒的多种原因，我们筛选出一组化学药剂有针对性地防治香菇烂筒。香菇烂筒防治剂A型既能防杀菇蝇、蚊也能杀螨、杀菌，是一种复合型的化合物；香菇烂筒防治剂B型具有特效杀菌功能；香菇烂筒防治剂C型则具有杀菇蝇、蚊及螨虫之功效。
使用方法：在菌袋培菌过程中喷施三次稀释1000倍的香菇烂筒防治剂A型。第一次在排筒前对菌筒周围环境进行直接喷施；第二次在剌孔放小气后喷施；第三次在剌孔放大气后喷施。若在翻堆时发现菌袋局部出现污染可采用注射法注入稀释1000倍B型或C型防治剂会完全抑制杂菌或虫害的扩散。
7、用双袋法防治香菇烂筒 “双袋法”的优点在于①是大大降低污染率与烂筒率；②是方法简单易行，减少在灭菌后还要检查是否有破袋的繁琐验袋操作过程；③是成本低，不必在接种口封腊或贴胶布，每个袋成本为1.5分，袋子且可多次利用；④是发菌快，其原因在于采用接种口封腊不如用双袋法来得透气。
具体做法是采用常规的方法装袋、灭菌，在灭菌后给每一个菇筒再套上一个62cm×15.5cm×0.001cm的聚乙稀烯膜袋，然后立即扎紧袋口，接种时只要拉下外袋打穴，接后再套上外袋并扎紧袋口，移入发菌室内培养：当菌丝长至直径12-15cm时，可以脱去外袋按常规工艺操作：
三、烂筒的处理
在菌筒发生生理性病害时应当及时采取措施加以防治。当菇筒出黄水阶段应用消毒后的竹尖将菌筒刺破让黄水排出，并用沾有消毒药水的棉布将黄水吸去；若发现菇筒局部出现污染与烂筒，应及时括去烂筒部位的培养料，采用注射法注入香菇烂筒防治剂或200倍多菌灵与甲基托布津并盖上一层石灰粉，另放置在干燥阴凉通风的其他培养室观察培养，防止交叉感染；
综上所述，防治香菇菇筒的“烂筒病”是一个综合防治的过程。从接种到培养菇筒，到下田排筒都要作好消毒防治工作．不能有任何的疏忽大意，每一个生产环节都要十分注意做好病虫害防治工作，避免发生生理性病害：一旦发现病虫害入侵，就要及时做好杀虫与灭菌工作，将烂筒的损失降低到最低程度。
