木耳基地遭受洪涝灾害通常导致耳棒被洪水冲走。一些发菌棚过水，木耳菌包被淹，将造成大面积损失。为降低受灾损失，特提出以下制袋及管理技术意见：
1、加强木耳棚的加固和清理
主要是对竹架进行打撑加固，对棚四周进行深沟排水，对棚内保持干燥，并撒干石灰粉或喷杀虫剂对发菌棚进行消毒杀虫，在确保耳棚无水患的前提下，再把预防菌包杂菌感染放在首位。
2、合理安排接种时期，调节好用工，选择适宜良种
不要盲目抢早制袋。在早期接种的耳农应该选择晚熟抗性强的品种如：新黑三、黑三等，7月中旬后接种的，可选择916等早熟品种。
3、加强栽培菌种的选择
农户在购买菌种时，一定要对供种单位进行考证，注意看企业技术水平，诚信情况，售后技术服务能力、经营管理水平等，同时对企业历年种子质量反馈信息进行调查。要选择技术优势强，诚信度高、服务能力强，管理水平好，种子经营手续完善、群众口碑好的企业购买菌种，并要求其出据相关票据，建立相应台账。
4、加强规范化栽培技术推广
以木屑为主料，添加石灰、麦麸等辅料制作培养料时，培养料含水量应控制在65%左右，装袋后单袋重量约1.6kg，灭菌时间100度后在14-16小时，接种后发菌温度应控制在27度以下。菌袋堆码一定要注意通风散热，一般不要超过6层。还要注意加强培养棚通风换气，菌丝封面后及时检查翻堆，剔除感染杂菌的菌包，回锅灭菌处理或拆袋加石灰拌料重种。
5、水淹发菌棚的管理
棚四周开深沟沥水，开大风扇加强棚内通风降湿，喷高效绿霉净防病，接种培养2周后及时翻堆检查，对感染较重的菌包拆袋配料重种，没有感染的加强杂菌预防。
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