盆景灵芝培育的基本流程与其栽培流程基本相同，只是增加了诱导造型工艺。即配料→装袋→灭菌→接种→发菌管理→埋土出芝→造型管理→成型加工。
1、选择品种
适合制作盆景的灵芝有红芝、鹿角灵芝、紫芝、黑芝等，以营造形态各异、色彩不一的造型艺术。红芝具色泽鲜红、芝盖圆正、轮纹清晰、柄长多曲等特点，为栽培首选品种；鹿角灵芝呈鹿角状、手指形，极具艺术观赏效果；紫芝、黑芝可以丰富观赏灵芝花色，通过不同处理，亦有良好造型。
2、造塑管理
通过对温度、湿度、空气、光线等环境因素的调控来改变灵芝生长是最主要造塑管理。具体措施如下。
①、调温 灵芝属中高温型菌类，在适温下子实体生长快，有利菌盖分化。低温生长慢，能刺激柄的伸长。通过拉大生长过程中温差变化，来调节灵芝的盖柄比例，主要措施有覆拱膜、大棚与遮阳网等。
②、调气 氧气充足有利于芝盖生长；二氧化碳浓度高则促进芝柄分化与伸长，生产上通过对子实体的几次套袋，产生几层形似宝塔状、千手观音等造型。
③、调光 灵芝生长具有明显趋光性，能在低温与弱光下促使色泽加深与菌盖加厚。可通过改变光源方向或调整出芝袋摆放方位，更换不同密度遮阳网等措施加以调节。
3、物理方法
灵芝以四周及底部白色生长点的方式进行加宽、加厚生长，生长点可通过施压、切割、包扎，进行抑制与切除，从而改变不同方向生长态势。也可通过嫁接方式将生长点引入芝柄、芝盖底部等部位，进行人为调整生长点方向、生长角度，造成灵芝子实体具有多方向、多层次立体造型。或利用压、拉、牵、攀等外力作用进行人工定位。
4、化学处理
不同药剂对灵芝生长点具有抑制或促进作用，目前常使用植物生长激素（三十烷醇）与矮壮素（多效唑）类物质，采用点涂法促进或控制不同分叉的生长速度，达到调节之目的。
5、选盆上盆
一般长方形的盆长度是宽度的s倍，深度适宜，一般高耸立式的山石景物配长方形稍深些的盆；立式较短形的山石景物可配方形盆；曲立式宜配长方形盆或椭圆形盆。盆内填充沙泥和泡沫塑料，将白石子与乳胶或玻璃胶拌和放入盆的上部，然后装入造型灵芝，干燥后即固定于盆内。
6、防治虫害
灵芝的子实层和菌管易被虫害侵入产卵、蛀蚀，平时宜摆放在通风干燥处，盆内放樟脑丸等防虫剂。若发现虫害应进行熏蒸、冷冻或曝晒处理；已被侵害处，可用酒精滴注，然后用石蜡或透明胶带封堵。为防止灰尘或虫害入侵，还可以用粘制玻璃罩或透明软塑料罩罩在盆景外面。
