（1）侵害食用菌的病虫种类繁多。据初步统计，对培养料、菌丝体和菇体造成直接侵害的病原菌有真菌、细菌、病毒等100多个种类。非侵染性种类有10多种。在虫害方面有15个目的昆虫能直接侵害食用菌的菌丝和子实体，种类达46种以上。
（2）营养丰富的栽培基质，为病虫繁殖提供了良好的食源。许多害虫和病菌以腐熟的有机质为食源，如跳虫、螨虫、瘿蚊、线虫、白蚁和蚤蝇等昆虫都喜食腐熟潮湿的有机质。经发酵熟化后用于栽培蘑菇、草菇和鸡腿蘑的基质能散发出特有的气味，吸引昆虫成虫在料里产卵。
（3）适宜的出菇环境，也为病虫繁殖提供了优越的条件。绝大多数种类的食用菌发菌温度在20~26℃，出菇温度在10~25℃，培养基内水分在65%左右，出菇场所空气湿度在85%以上。与此同时，也适合病虫生活的条件，病虫繁殖和为害的速度也达到最快值。
（4）食用菌与病菌在生理特性上差异性小，生理性较一致。许多杀菌药易伤害菌丝和菇体，引起药害。
（5）培养基质携带病虫源。绝大多数的致病菌和有害昆虫，其寄主都是有机质。例稻草、棉籽壳，另外禽畜粪便本身就携带大量病菌孢子、菌体、螨虫和蚊蝇等虫卵。
（6）病虫同时侵入、交叉感染。菇蚊、菇蝇身上携带螨虫和病菌，当其在培养基和菇体上取食和产卵时就传播病毒、螨虫和病菌。
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