发酵采用的原理是利用微生物活动产生的热量，在一定时间和温度范围内杀死杂菌芽孢的过程，从而达到灭菌的目的。此技术已广泛应用于各领域，此乃法国科学家巴斯德发明的，被称为巴氏消毒灭菌法。下面为大家介绍食用菌发酵料的使用方法及注意事项：
首先，原料配比要科学
严禁胡搭乱配。注意碳氮比例!每个技术人员都有自己经验配方。千万不要道听途说，没有经过检验就大量投入，避免因此导致一败涂地!
其二，拌料
重要的是均匀一致。将配方中的各种原料按量加入，充分搅拌均匀，尤其是水分，调整好水分才能在每一次翻堆过程中节省时间与成本。石灰重中之重，因每次堆温上升就会导致PH值下降，因此要根据各地水质因地制宜。
其三，发酵
发酵料在发酵过程中是“有氧发酵”。在每次建堆后都要在料堆上均匀打孔成品字形排列，供给充足的氧气排出有害气体。千万不要覆盖薄膜，厌氧只会使原料发酸发臭。每次翻堆都要将原料充分散开挥发掉有害气体，争取将原料内层的翻到外层，将未腐区的原料放到高温区进行腐熟，因为每次发酵的高温区在表层以下15-20厘米左右，所以温度计测温应以温度计插入深度15-20厘米为标准。
其四，确保食用菌的绿色
有的人在食用菌栽培中使用化肥或农药，如果你的产品因此被禁入各大商超，只会砸了食用菌的招牌!如果必须用药请使用低毒残留短的。发酵料一般常规用药只是在发酵环节调节水分时低浓度使用。切记!
其五，每次翻堆注意的温度
书本上说达到60度翻堆。实际操作过程中一般会达到65-70才会翻堆，从而可以保证发酵料维持温度的时间。
凡经过此法处理后的原料，栽培中被污染的几率很低，同时增加了原料的腐熟程度，可以起到吃料快、增加产量的作用。
