1．排放菌袋
菌袋培养发菌期间，因气温不同采取不同的堆码方式，使其有利于温度控制管理。当气温高于25℃时，应将菌袋单层排放在床架上或“井”字形地堆码在培养室内地面上，共堆码5～6层；也可先在地面上排放一层菌袋，然后排放2根竹竿后，再排放菌袋，如此一层菌袋一层竹竿地排放，使上下层菌袋之间间隔开来，有利于散热降温。在冬季温度较低时，将菌袋多层重叠排放在床架上，并关闭门窗进行保温；或者横积排放在地面上，每排重叠6～7层菌袋，每排之间相距10厘米左右，须在菌袋堆上覆盖塑料薄膜或编织袋进行保温。菌种瓶排放在床架上，或横卧排放在地面上，进行保温保湿培养。
2．环境条件控制管理
培养发菌期间，对黄色金针菇要将温度控制在23℃～25℃之间，并且做好保温管理是关键；在20℃以下培养时，菌丝体尚未生长满袋就会出菇，因此，要将温度控制在20℃以上。白色金针菇可在18℃～20℃下培养发菌。空气相对湿度控制在80％以下，并加强通风换气，防止出现高温高湿环境引起杂菌感染。用绳或橡皮筋环扎袋口培养发菌的，当菌丝体生长到袋的l／2体积时，改为在袋口上套上颈圈，并用纸封口，以增加通气性，促使菌丝体生长速度加快；同时，为出菇做好准备。培养至菌丝体长满瓶或袋后，即可进行出菇管理。此外，由于黄色金针菇菌丝体没有长满袋就具备出菇能力，因此，可以在菌丝生长到袋的l／2体积时，进行出菇管理，这样可提早出菇。白色金针菇由于出菇较晚，菌丝体长满瓶或袋后，再培养10天左右，使其生理成熟后，再进行出菇管理，有利于提高产量和质量。
