一、头茬菇太密，转潮困难
症状：头潮菇多、个体小，甚至成丛的菇蕾将覆土掀起，造成大批小菇因脱离料面死亡，难出二潮菇。是由于菌棒过密，或菌棒过长，料层过厚导致的。
克服办法：拉大菌棒间距至2－3厘米，并用土将菌棒间缝隙填实；或把菌棒切成两段或把菌棒卧放出菇。
二、出菇不在床面
症状：床面出菇极少而四周土埂出菇较多。是覆土厚度不当，床土干而散，四周土层较潮湿导致的。
克服办法：覆土不超过3厘米，覆土含水量控制在20％－30％之间。
三、菌丝“冒土”
症状：菌丝冒出床面，甚至形成菌被。菌丝徒长。
克服办法：当菌丝快长至床面时，加强通风，使床土表面干燥，促进菌丝向生殖生长转化。如果是轻微冒菌丝，可加强通风，床面撒草木灰即可；若菌丝形成菌被，可用刀划掉，挑掉菌块，喷打重水，增通风，床面补换细土。
四、大量发生“红头”菇
症状：菌盖鳞片呈铁锈色，但不深入菌肉，不影响生长发育。是由于床料和空气湿度大，光线不适宜。
克服办法：当子实体出土后，喷水必须结合进行通风，不喷关门水，以保持菇体表面无水和有适宜的光照强度。
五、鸡爪菇
症状：菇体从基部长出3－5个分枝似鸡爪（褐色）。是由于高温高湿、菌丝受土层杂菌侵染引起的病态。
克服办法：保持适宜的床料和空气湿度，搞好环境卫生，覆土经灭菌后再行使用。
